ელექტროფორეზის სისტემა შედგება ორი ძირითადი კომპონენტისგან: ელექტრომომარაგება და ელექტროფორეზის პალატა. ელექტრომომარაგება კვებავს ელექტროენერგიას. "ძალა", ამ შემთხვევაში, არის ელექტროენერგია. ელექტროენერგია, რომელიც მოდის ელექტრომომარაგებიდან, მიედინება ერთი მიმართულებით, ელექტროფორეზის კამერის ერთი ბოლოდან მეორეზე. კამერის კათოდი და ანოდი არის ის, რაც იზიდავს საპირისპიროდ დამუხტულ ნაწილაკებს.
ელექტროფორეზის კამერის შიგნით არის უჯრა - უფრო ზუსტად, ჩამოსხმის უჯრა. ჩამოსხმის უჯრა შედგება შემდეგი ნაწილებისგან: შუშის ფირფიტა, რომელიც მიდის ჩამოსხმის უჯრის ძირში. ლარი ინახება ჩამოსხმის უჯრაში. "სავარცხელი" მის სახელს ჰგავს. სავარცხელი მოთავსებულია ჭრილებში ჩამოსხმის უჯრის გვერდით. მას ათავსებენ ჭრილებში ცხელი, გამდნარი გელის ჩასხმამდე. გელის გამაგრების შემდეგ სავარცხელი ამოღებულია. სავარცხლის "კბილები" ტოვებს პატარა ნახვრეტებს გელში, რომელსაც ჩვენ "ჭებს" ვუწოდებთ. ჭაბურღილები მზადდება, როდესაც ცხელი, გამდნარი გელი გამაგრდება სავარცხლის კბილების გარშემო. სავარცხელი გამოიყვანება გელის გაციების შემდეგ, ტოვებს ჭებს. ჭაბურღილები უზრუნველყოფენ ადგილს იმ ნაწილაკების დასაყენებლად, რომელთა გამოცდაც გსურთ. ადამიანი ძალიან ფრთხილად უნდა იყოს, რომ ნაწილაკების ჩატვირთვისას გელი არ დაირღვეს. გელის გატეხვა ან გატეხვა სავარაუდოდ იმოქმედებს თქვენს შედეგებზე.